Constitués par le comité de pilotage, les groupes de travail ont un rôle d'élaboration technique et scientifique, au plus près du terrain. Ce sont des instances de réflexion qui permettent au comité de pilotage de prendre des décisions.
Suite à l'extension du périmètre du site Natura 2000, il est désormais nécessaire d’approfondir les connaissances sur le périmètre étendu et en particulier de disposer d’une cartographie des habitats sur l’ensemble du site. Un important travail a été réalisé au printemps 2023 sur l'identification des boisements d'intérêt communautaire par Mallaury Lacombe, étudiante en Master 2 Gestion et Conservation de la Biodiversité.
Cela a permis ensuite d'identifier en groupe de travail en juin et septembre 2023 de nouveaux enjeux pour le document d'objectifs et d'élaborer des propositions d'actions à travers la définition de nouveaux objectifs du Docob.